Vad är skillnaden mellan 16s rRNA och 18s RRNA?
Vad är skillnaden mellan 16s rRNA och 18s RRNA?
Anonim

Den huvudsakliga skillnad mellan utföra analyser med 18S rRNA gendata istället för 16S rRNA gendata (eller ITS-data) är referensdatabasen som används för OTU-plockning, de taxonomiska tilldelningarna och den mallbaserade anpassningsbyggnaden, eftersom den måste innehålla eukaryota sekvenser.

Med tanke på detta, varför används 16s rRNA-genen för identifiering?

De 16S ribosomal RNA-gen kodar för RNA-komponenten i 30S-subenheten i den bakteriella ribosomen. På grund av komplexiteten i DNA-DNA-hybridisering, 16S rRNA-gen sekvensering är Begagnade som ett verktyg för att identifiera bakterier på artnivå och hjälper till att skilja mellan närbesläktade bakteriearter [8].

Har eukaryoter dessutom 16s rRNA? De 16S rRNA genen finns i alla bakterier, och en besläktad form förekommer i alla celler, inklusive de av eukaryoter.

Frågan är också, vad är 18s och 28s rRNA?

De 28S / 18S ribosomalt RNA förhållande används ofta för att bedöma kvaliteten på totalt RNA renat från ett givet prov. I människor, 28S rRNA har ~5070 nukleotider, och 18S har 1869 nukleotider, vilket ger en 28S / 18S förhållande på ~2,7. En hög 28S / 18S förhållandet är en indikation på att det renade RNA:t är intakt och inte har brutits ned.

Vad är 16s rRNA-sekvensering?

16S rRNA gen sekvens analys är en standardmetod inom bakteriell taxonomi och identifiering, och baseras på detektering av sekvens skillnader (polymorfismer) i de hypervariabla regionerna i 16S rRNA gen som finns i alla bakterier.

Rekommenderad: