Vad är skillnaden mellan 16s rRNA och 18s RRNA?
Vad är skillnaden mellan 16s rRNA och 18s RRNA?

Video: Vad är skillnaden mellan 16s rRNA och 18s RRNA?

Video: Vad är skillnaden mellan 16s rRNA och 18s RRNA?
Video: ДНК против РНК (обновлено) 2024, November
Anonim

Den huvudsakliga skillnad mellan utföra analyser med 18S rRNA gendata istället för 16S rRNA gendata (eller ITS-data) är referensdatabasen som används för OTU-plockning, de taxonomiska tilldelningarna och den mallbaserade anpassningsbyggnaden, eftersom den måste innehålla eukaryota sekvenser.

Med tanke på detta, varför används 16s rRNA-genen för identifiering?

De 16S ribosomal RNA-gen kodar för RNA-komponenten i 30S-subenheten i den bakteriella ribosomen. På grund av komplexiteten i DNA-DNA-hybridisering, 16S rRNA-gen sekvensering är Begagnade som ett verktyg för att identifiera bakterier på artnivå och hjälper till att skilja mellan närbesläktade bakteriearter [8].

Har eukaryoter dessutom 16s rRNA? De 16S rRNA genen finns i alla bakterier, och en besläktad form förekommer i alla celler, inklusive de av eukaryoter.

Frågan är också, vad är 18s och 28s rRNA?

De 28S / 18S ribosomalt RNA förhållande används ofta för att bedöma kvaliteten på totalt RNA renat från ett givet prov. I människor, 28S rRNA har ~5070 nukleotider, och 18S har 1869 nukleotider, vilket ger en 28S / 18S förhållande på ~2,7. En hög 28S / 18S förhållandet är en indikation på att det renade RNA:t är intakt och inte har brutits ned.

Vad är 16s rRNA-sekvensering?

16S rRNA gen sekvens analys är en standardmetod inom bakteriell taxonomi och identifiering, och baseras på detektering av sekvens skillnader (polymorfismer) i de hypervariabla regionerna i 16S rRNA gen som finns i alla bakterier.

Rekommenderad: